Piłka nożna istniała w Bełchatowie już od 1930 r. Początkowo jako klub pod nazwą RKS „Skra”. Gdy jednak w połowie lat 70. rozpoczęto budowę Kopalni Węgla Brunatnego „Bełchatów”, postanowiono założyć klub piłkarski z prawdziwego zdarzenia. I tak za oficjalną datę założenia GKS Bełchatów uznaje się 26 listopada 1977 r. Wówczas to sekcja piłki nożnej została przekazana z klubu MZKS „Skra” (dawniej RKS „Skra”) do nowo powstałego Górniczego Klubu Sportowego „Węgiel Brunatny” Bełchatów. Zespół rozpoczął zmagania ligowe od rozgrywek A klasy.
Klub GKS Bełchatów został założony w 1977. Do 31 stycznia 2002 funkcjonował jako stowarzyszenie sportowe, natomiast jako sportowa spółka akcyjna, występuje od 1 lutego 2002 r.
Od początku powstania klubu, jego strategicznym sponsorem, a zarazem właścicielem jest Kopalnia Węgla Brunatnego „Bełchatów”. Pierwsza nazwa bełchatowskiego zespołu brzmiała zatem: Górniczy Klub Sportowy „Węgiel Brunatny” Bełchatów. W 1983 r. została ona skrócona do Górniczy Klub Sportowy „Bełchatów”. A po 22 latach, w wyniku utworzenia holdingu BOT (2005), w skład którego wchodziła KWB „Bełchatów”, do nazwy zespołu dołączony został człon „BOT”. Klub przyjął nazwę GKS BOT Bełchatów. W sezonie 2006/2007 drużyna występowała jako BOT GKS Bełchatów. Od sezonu 2007/2008 do końca sezonu 2011/2012 drużyna nosiła nazwę PGE GKS Bełchatów.
We wrześniu 2014 do Sądu Rejonowego w Bełchatowie wpłynął akt oskarżenia ws. 29 mających ustawiać mecze GKS.